宝典输入需在游戏进行中通过键盘直接操作，无需暂停或切换界面。原版输入法通常需要按住Ctrl键并依次按下对应字母键，而重制版部分版本支持直接输入字符串。成功触发宝典时，通常会伴随短促音效或屏幕闪烁提示，例如输入NOD可为NOD阵营增加10000资金，资源数值会立即刷新。宝典仅在任务玩法或遭遇战中生效，多人联机对战玩法下无法运用。

资源操控类宝典是游戏中最实用的功能其中一个，包括NOD或GDI为对应阵营增加资金，SWITCH可切换当前控制阵营（仅限遭遇战玩法）。建筑和单位类宝典如BIGBANG能瞬间摧毁地图上全部敌方单位，ONLY可解开全部科技树，但需确保建造厂未被摧毁。地图和视野控制宝典BLIND能永久消除战争迷雾，而XRAY可短暂显示敌方单位轮廓。部分宝典可组合生效，例如先输入ONLY解开科技，再运用NOD补充资金，可快速组建顶级兵种军团，单位生产类宝典也许引发程序冲突，提议间隔5秒以上执行。

隐藏关卡是重制版的重要彩蛋内容，需通过特定操作触发。恐龙关卡的开始方法是在游戏菜单界面按住Shift键不放，依次点击四个铆钉。巨蚁关卡的触发条件则和主菜单界面特定交互有关。这些隐藏关卡不仅提供特殊剧情尝试，还也许包含独特奖励单位或资源。宝典SPEED可将游戏速度提高至3倍，重复输入可复位，该功能在重复刷资源或快速完成建造时极为实用。

高阶操作中，暂停游戏后输入宝典可避免操作中断，例如在抵御大规模进攻时暂停并激活ONLY可安全部署顶级防御设施。重制版对部分宝典进行了调整，如MCVHAUL（立即获取机动基地车）仅在原版生效，LEPTON（解开离子炮）需完成至少一次GDI战役后方可激活。过量运用建造类宝典也许导致内存溢出，提议优先规划核心属性和装备流派。